جهت نصب Rkhunter بوسیله برنامه Putty وارد SSH سرور مجازی یا اختصاصی خود شوید.
wget آدرس داونلود که از سایت روبرو آخرین نسخه را بگیرید http://rootkit.nl/projects/rootkit_hunter.html
tar -zxvf rkhunter-1.3.6.tar.gz
cd rkhunter-1.3.6
./installer.sh
جهت اسکن کردن سرور به صورت دستی از دستور /usr/local/bin/rkhunter -c می توانید استفاده کنید.
جهت تنظیم اسکن خودکار روزانه بوسیله Cron Job از دستور pico /etc/cron.daily/rkhunter.sh استفاده کنید و پس از باز شدن فایل دستورات زیر را در آن کپی و آدرس ایمیل خود را نیز جایگزین کنید.
#!/bin/bash
(/usr/local/bin/rkhunter -c --cronjob 2>&1 | mail -s "Daily Rkhunter Scan Report" email@domain.com)
و جهت بروزرسانی این ابزار از دستور rkhunter --update استفاده کنید. بهتر از هر از مدتی یکبار این دستور را اجرا کنید.